cis-meQTLs-eQTMs Analysis
Dexamethasone-Stimulated Human Array Project
Anastasiia Hryhorzhevska
Max Planck Institute of Psychiatryanastasiia_hry@psych.mpg.de
Last compiled on 22 August, 2022
Plots
B-cells
No base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$no_base$plt.meqtl, plt.res$no_base$plt.eqtl, plt.res$no_base$scatter.plt,
nrow = 1))
With base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$with_base$plt.meqtl, plt.res$with_base$plt.eqtl, plt.res$with_base$scatter.plt,
nrow = 1))
CD4mem
No base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$no_base$plt.meqtl, plt.res$no_base$plt.eqtl, plt.res$no_base$scatter.plt,
nrow = 1))
With base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$with_base$plt.meqtl, plt.res$with_base$plt.eqtl, plt.res$with_base$scatter.plt,
nrow = 1))
CD4nv
No base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$no_base$plt.meqtl, plt.res$no_base$plt.eqtl, plt.res$no_base$scatter.plt,
nrow = 1))
With base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$with_base$plt.meqtl, plt.res$with_base$plt.eqtl, plt.res$with_base$scatter.plt,
nrow = 1))
CD8mem
No base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$no_base$plt.meqtl, plt.res$no_base$plt.eqtl, plt.res$no_base$scatter.plt,
nrow = 1))
With base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$with_base$plt.meqtl, plt.res$with_base$plt.eqtl, plt.res$with_base$scatter.plt,
nrow = 1))
Neu
No base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$no_base$plt.meqtl, plt.res$no_base$plt.eqtl, plt.res$no_base$scatter.plt,
nrow = 1))
With base effect
grid.arrange(arrangeGrob(plt.res$with_base$plt.meqtl, plt.res$with_base$plt.eqtl, plt.res$with_base$scatter.plt,
nrow = 1))